又称为火山庙、新岩，供奉观世音菩萨，原为大仙寺庙产，1931年才独立出来。走进碧云寺的山门殿，可见一座高大的白色观音塑像，及十八罗汉像浮雕，再往前则是大雄宝殿，整殿以大理石铺设，显得美仑美奂；殿旁有石阶通往后山僻静的竹林，是休闲散步的好地方。

该寺始建于元朝至顺二年(1331)，元丞相耶律楚材之后裔耶律阿吉舍宅为寺，初名碧云庵，后改碧云寺。明清两代均有扩建。明正德年间太监于径看中了这块风水宝地，大兴土木，为第一次扩建，并在寺后为自己修建坟墓。嘉靖初年于径获罪，不能在此处葬身。天启年间太监魏忠贤又扩建庙宇，再次建坟，准备死后葬此。崇祯初年，魏忠贤自缢后被戮尸，也不能再葬于此。魏忠贤的党羽葛九思，1644年随清军入京，将魏之衣冠葬在墓中，成为魏的衣冠冢。直到康熙四十年(1704)，江南道监察御史奉命巡视西山时，初以为是前朝皇帝陵寝，后来知道是魏坟，遂于五月十二日上奏，二十二日诏平其坟。乾隆十三年(1748)，对寺宇重加修葺，并按西僧所贡奉的图样，建起了金刚宝座塔，同时新建了行宫和罗汉堂，对其他殿宇无大变动。所以寺内殿宇基本是明代结构。 1925年孙中山先生在京逝世后，曾在该寺的后殿停过灵柩，因而此殿后改为中山堂。金刚宝座塔下，成为孙中山衣冠冢。 "文化大革命"期间，寺门内的哼哈二将等塑像被毁。"文革"之后，对该殿进行过重修。1983年将颐和园东门外因拓宽马路而委弃路旁的孙中山画像纪念碑,移建寺内金刚宝座塔前空地上。